Los denominados Memos de Atlasti son documentos internos del programa que funcionan como Memorandos, y pueden ser relacionados con los diferentes objetos del programa. Según Saldaña (‘The coding Manual for Qualitative Researchers’) las funcionalidades de estos Memorandos pueden ir desde un registro de las reflexiones acerca del preguntas de la investigación, la elección de códigos y sus descripciones, un diario sobre cómo se va realizando el análisis recogiendo la emergencia de temas, conceptos y teorías de los datos, las relaciones entre los diferentes elementos del proyecto (documentos, citas, códigos, redes) y la redacción de las diferentes partes del Informe.